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艾莉森·桑托洛在實驗室里培育消耗氨的微生物
據鳳凰科技:生物學家發現古生菌非常有趣,它組成了生命的三個主要分支之一 。前兩個已知的分支是細菌和真核生物,最后一個分支包括動物、植物和真菌 。但古生菌非常神秘 , 科學家對它的了解非常有限 。事實上,它們獨特的狀態直到1977年才被科學家所認識 。
如水晶般清澈的海里充滿了各種不可見的生命體 。全世界的海洋包含40億噸神秘的微生物古生菌 , 大約相當于全世界魚類的總重量 。科研船只上的科學家們準備將一項名為CTD-rosette 采水器的設備放進海洋里 。這個采水器能夠收集海洋不同深度的海洋樣本,從海洋表面到海底數千英尺深處 。這樣獲得的海水樣本使得科學家能夠發現生活在深海的微生物 。
每天上億噸重的魚類、哺乳動物、植物和其它海洋生物體死在海里 。隨著它們的腐爛,它們會釋放出惡臭性氣體氨 。“水族館里一點氨就足以殺死全部魚類 。”美國西雅圖華盛頓大學的微生物生態學家大衛·斯特爾(David Stahl)這樣說道 。海洋里太多氨將相當于劇毒 。
但是海洋里的氨不會堆積到有害的程度 。在過去的50年間,科學家一直好奇究竟是什么清除了氨 , 他們假定微生物是其中一員,但究竟是哪些微生物呢?海洋里有上百萬種不同類型的微生物,只有少數會消耗氨 。
美國馬里蘭大學環境科學研究中心的科學家艾莉森·桑托洛(Alyson Santoro)正在積極尋找這些神秘的微生物 。她認為某種未知的古生菌物種可能在氨剛形成時就迅速消耗了它,并將其轉化為其它化學物質 。這些古生菌甚至可能是第二個神秘之謎的關鍵所在——大量一氧化二氮氣體的來源 。每年海洋里有近200萬噸一氧化二氮進入大氣層,成為溫室氣體 。它比二氧化碳吸收更多的太陽光,并且更大程度地加熱了大氣層 。
沒有人知道這種一氧化二氮背后的生命形式,所有生物學家知道這種氣體具有某種奇特的化學特征,它和吸收氨的微生物一樣,都是科學界的未知 。盡管它非常神秘,但這種微生物可能是地球上最常見的生命形式,然而過去幾十年生物學家都沒有研究它們,原因很簡單:他們無法在實驗室里培育這種生物 。
圖4透過顯微鏡看到的以氨為食的古生菌(圖中顯示為綠色,主要是因使用的特殊化學物質所致,以便更清晰的觀看) 。這種古生菌生活在美國加州海岸海底名為天然海綿(一種簡單的多細胞海洋動物)的動物體內 。圖中顯示的紅色細胞屬于天然海綿的 。
很難培育
一般來說,生物學家會將神秘微生物放在玻璃瓶或者培養皿上培育它們,當獲得大量微生物后他們就能鑒別其類屬,或者進行實驗觀察它們所吃的食物或者生活方式 。“你必須嘗試不同的溫度和食物”,桑托洛補充說道 。
桑托洛收集的海水樣本包含上百萬種不同類型的微生物,但大約99%從未在實驗室環境內培育出 。“還有很多微生物拒絕在實驗室里生長,”麻省理工學院的微生物生態學家愛德華·德?。‥dward DeLong)這樣說道 。微生物拒絕在實驗室里生長讓科學家困惑不已,這使得科學家們很難理解它們是如何影響環境的 。

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研究里收集的海水樣本瓶 。它們看起來是空的,但實際上包含上百萬種不同類型的微生物 。
實驗室培養微生物
研究海洋微生物群落是非常具有挑戰性的 。在實驗室里培育并觀察微生物生態系統會改變微生物本身 , 且沒有任何科學家可以預測它將如何改變 。玻璃瓶里的條件與真實海洋里的完全不同,很可能玻璃瓶里的水包含更多食物 。這將導致玻璃瓶里的微生物生長速度超過海洋里緩慢增長的微生物 。
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