研究人員跨越數(shù)千年試圖了解黑死病難以捉摸的起源 _黑死病

史密斯菲爾德瘟疫坑，在1348年和1349年用于集體埋葬。圖片來源：倫敦考古博物館（MOLA）

東史密斯菲爾德瘟疫坑，在1348年和1349年用于集體埋葬。圖片來源：倫敦考古博物館（MOLA）
據(jù)美國物理學家組織網(wǎng)（麥克馬斯特大學）：為了更好地了解腺鼠疫的起源和運動，在古代和當代，麥克馬斯特大學，悉尼大學和墨爾本大學的研究人員完成了對數(shù)百個現(xiàn)代和古代基因組序列的艱苦粒度檢查，創(chuàng)建了同類分析中規(guī)模最大的分析。
盡管DNA技術和分析取得了巨大進步，但眾所周知，瘟疫的起源，進化和傳播仍然難以確定。
瘟疫是人類歷史上最大規(guī)模和最致命的兩種流行病的罪魁禍首。然而，這些的潮起潮落，為什么有些消亡而另一些持續(xù)多年，讓科學家們感到困惑。
在今天發(fā)表在《通信生物學》雜志上的一篇論文中，麥克馬斯特研究人員使用全面的數(shù)據(jù)和分析來繪制他們所能繪制的關于鼠疫桿菌高度復雜的歷史，鼠疫桿菌是引起鼠疫的細菌。
該研究分析了來自世界各地的600多個基因組序列，涵蓋了5000年前瘟疫首次出現(xiàn)在人類中，查士丁尼瘟疫，中世紀黑死病和當前（或第三次）大流行，始于20世紀初。
“瘟疫是人類歷史上最大的流行病和最大的死亡事件。它何時出現(xiàn)，從什么宿主那里可以揭示它來自哪里，為什么它數(shù)百年來不斷噴發(fā)，在某些地方消失，但在其他地方持續(xù)存在。最終，為什么它殺死了這么多人，“麥克馬斯特古代DNA中心主任進化遺傳學家Hendrik Poinar解釋說。
Poinar是Michael G. DeGroote傳染病研究所和麥克馬斯特全球流行病和生物威脅關系的首席研究員。
研究小組研究了全球分布和不同年齡的菌株的基因組，并確定鼠疫桿菌具有不穩(wěn)定的分子鐘。這使得測量突變隨時間在其基因組中積累的速度變得特別困難，然后用于計算出現(xiàn)日期。
由于鼠疫桿菌的進化速度非常緩慢，因此幾乎不可能確定其起源的確切位置。
人類和嚙齒動物通過旅行和貿易將病原體攜帶到全球，使其傳播速度比其基因組進化速度更快。例如，在俄羅斯、西班牙、英國、意大利和土耳其發(fā)現(xiàn)的基因組序列盡管相隔多年，但它們都是相同的，這給確定傳播途徑帶來了巨大的挑戰(zhàn) 。
為了解決這個問題，研究人員開發(fā)了一種區(qū)分鼠疫桿菌特定種群的新方法，使他們能夠識別和確定歷史上的五個種群，包括他們現(xiàn)在估計最著名的古代大流行譜系，這些譜系在歐洲歷史上記錄大流行之前幾十年甚至幾個世紀就出現(xiàn)了。
“你不能認為瘟疫只是一種細菌， ”Poinar解釋說。“背景非常重要，我們的數(shù)據(jù)和分析表明了這一點。
為了正確重建我們過去、現(xiàn)在和未來的流行?。貳⑸⒒肪場⑸緇岷臀幕塵巴匾?。
他解釋說，僅靠遺傳證據(jù)不足以重建短期鼠疫大流行的時間和傳播，這對未來與過去大流行相關的研究以及COVID-19等持續(xù)爆發(fā)的進展具有影響。