
約翰.霍普金斯大學(xué)Kimmel癌癥研究中心:一次血液檢測篩查八種類型癌癥
()據(jù)EurekAlert!:約翰.霍普金斯大學(xué)Kimmel癌癥研究中心(Johns Hopkins Kimmel Cancer Center)的研究人員開發(fā)了一種能夠篩選八種常見類型癌癥的單一血液檢測 , 該方法還有助于癌癥的定位 。
這種名為CancerSEEK的檢測方法是一項(xiàng)獨(dú)特的無創(chuàng)多分析測試 , 它可同時(shí)評(píng)估八種癌癥蛋白的水平和血液中循環(huán)DNA的癌癥基因突變 。這項(xiàng)檢測旨在篩選占美國癌癥死亡人數(shù)60%以上的八種常見類型的癌癥 。其中可以由該方法進(jìn)行篩查的五種癌癥 , 此前不具備任何篩查檢測方法 。
該文資深作者,腫瘤與病理學(xué)教授Nickolas Papadopoulos, Ph.D.,表示:“將選定的不同生物標(biāo)記物聯(lián)合用于早期檢測有可能改變我們篩查癌癥的方式,該檢測是基于與藥物組合治療癌癥相同的原理 。”
該研究的發(fā)現(xiàn)在線發(fā)表在《科學(xué)雜志》Science上 。
該文第一作者,約翰.霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的M.D.-Ph.D.學(xué)生Joshua Cohen說:“循環(huán)腫瘤DNA突變可能是癌癥的高度特異性標(biāo)記物 。為了利用這種內(nèi)在的特異性,我們試圖開發(fā)一個(gè)小而強(qiáng)大的特異性標(biāo)記物組合來檢測絕大多數(shù)癌癥的至少一個(gè)突變 。而事實(shí)上 , 使該組合規(guī)模盡量的小,這對(duì)于減少假陽性結(jié)果至關(guān)重要,并且還能讓人負(fù)擔(dān)得起篩查檢測費(fèi)用 。”
研究人員探索了數(shù)百個(gè)基因和40個(gè)蛋白質(zhì)標(biāo)記物,并最終將其數(shù)量減少到16個(gè)基因和8個(gè)蛋白 。他們指出,這種分子檢測旨在僅進(jìn)行癌癥篩查,因此它與其它分子檢測方法有所不同,后者是旨在通過分析大量癌癥相關(guān)基因來發(fā)現(xiàn)癌癥治療的靶點(diǎn) 。
在這個(gè)研究中,該測試對(duì)癌癥的特異性大于99% 。腫瘤學(xué)教授兼路德維希中心(the Ludwig Center)的聯(lián)合主任Kenneth Kinzler, Ph.D.表示:“非常高的特異性是必不可少的,因?yàn)榧訇栃越Y(jié)果會(huì)使患者接受不必要的有創(chuàng)隨訪檢查和手術(shù)以確認(rèn)癌癥的存在 。在被用于812名健康對(duì)照時(shí),該檢測僅產(chǎn)生了7個(gè)假陽性結(jié)果 。”
該檢測在1,005名非轉(zhuǎn)移性I至III期卵巢癌,肝癌,胃癌,胰腺癌 , 食管癌,結(jié)直腸癌,肺癌或乳腺癌患者中進(jìn)行了評(píng)估 。該檢測的總體敏感度中位數(shù)(即發(fā)現(xiàn)癌癥的能力)為70%,其范圍從卵巢癌的98%至乳腺癌的33% 。對(duì)于目前不具備篩查檢測的五種癌癥(卵巢癌,肝癌,胃癌,胰腺癌和食管癌)而言,其敏感度在69%至98%之間 。
開發(fā)了該檢測的算法的腫瘤和生物統(tǒng)計(jì)副教授Cristian Tomasetti, Ph.D.表示:“我們的分類方法的一個(gè)新穎之處在于,它將觀察DNA突變以及幾種蛋白質(zhì)表達(dá)水平的可能性結(jié)合起來,以得出最終的檢測結(jié)果 。該方法的另一個(gè)新穎之處在于它使用了機(jī)器學(xué)習(xí)來使檢測能夠在83%的患者中把腫瘤準(zhǔn)確定位到很少的幾個(gè)解剖部位 。”
雖然目前的檢測還不能檢測出每一種癌癥,但是它能夠檢測到很多以前很可能不會(huì)被發(fā)現(xiàn)的癌癥 。路德維希中心(the Ludwig Center)的聯(lián)合主任 , Clayton腫瘤學(xué)教授兼霍華德.休斯醫(yī)學(xué)研究所(Howard Hughes Medical Institute)研究員Bert Vogelstein, M.D.,表示:“在大多數(shù)最具希望的癌癥治療方法中,很多是僅能使少數(shù)癌癥患者獲益 。如果我們要在早期癌癥檢測方面取得進(jìn)展,我們必須以更現(xiàn)實(shí)的方式進(jìn)行研究,要認(rèn)識(shí)到?jīng)]有任何一種方法可以檢測到所有的癌癥 。”
為了確定CancerSEEK檢測應(yīng)該包括的分析物,研究小組使用了30多年來約翰.霍普金斯大學(xué)路德維希中心(Johns Hopkins Ludwig Center)的癌癥遺傳學(xué)研究數(shù)據(jù) , 以及來自許多其它機(jī)構(gòu)的數(shù)據(jù):路德維希中心是首個(gè)癌癥遺傳圖譜的誕生地 。
為了精確地確定在CancerSEEK檢測中使用的DNA堿基的最佳數(shù)量,研究人員使用了基于收益遞減原理的方法來使該檢測包括那些對(duì)癌癥檢測確實(shí)有用的DNA標(biāo)記物 , 并剔除了沒有增益效果的DNA標(biāo)記物,其結(jié)果是得到一個(gè)相對(duì)較小的高選擇性DNA標(biāo)記物組合 。
醫(yī)學(xué),外科和放射學(xué)副教授,消化內(nèi)科臨床主任和多學(xué)科胰腺囊腫項(xiàng)目主任Anne Marie Lennon, M.D., Ph.D.說:“最理想的狀態(tài)是,癌癥能夠被盡早地檢測出來 , 并且通過手術(shù)就可以治愈;即使是單純手術(shù)無法治愈的癌癥,在其疾病發(fā)展程度較低時(shí),對(duì)治療的反應(yīng)也會(huì)更好 。”
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