基因測序全面揭示乙肝病毒整合機制 _基因

2012年5月28日，由香港大學、新加坡國立大學、深圳華大基因研究院、亞洲癌癥研究組織ACRG（由禮來公司、默克公司和輝瑞公司創建）共同完成的乙型肝炎病毒（簡稱乙肝病毒， HBV）整合機制研究成果（Genome-wide Survey of Recurrent HBV Integration in Hepatocellular Carcinoma）于國際權威雜志《自然-遺傳學》（Nature Genetics）上在線發表。該研究從全基因組水平上首次構建了一個高精度無偏差的乙肝病毒整合（HBV Integration）圖譜，揭示了潛在的乙肝病毒整合機制，為肝癌的早期診斷、治療及靶向藥物研發等提供了非常寶貴的資源。
肝細胞癌（hepatocellular carcinoma, HCC）（以下簡稱為肝癌）是目前常見的惡性腫瘤之一，全世界每年約有100萬人死于肝癌。我國肝癌發病率居世界之首，且肝癌死亡率很高，已成為我國第2大癌癥殺手。乙肝病毒的基因可以整合入肝細胞基因組中，故稱之為乙肝病毒整合。目前，乙肝病毒整合被認為在肝癌發生過程中具有重要作用。許多研究人員已在此方面展開大量的研究，但由于技術和臨床樣本數量的限制，嚴重阻礙了相關研究的進一步開展。
在本研究中，科研人員分別對來自81例HBV陽性患者和7例HBV陰性患者的癌組織樣本和癌旁組織樣本進行了全基因組測序及分析。結果發現HBV整合在肝癌中是一種普遍現象，HBV整合頻率在癌組織中（86.4%）明顯高于癌旁組織（30.7%）。結合轉錄組測序數據分析后，研究人員發現了3個新的HBV整合位點（CCNE1, SENP5, ROCK1），并推測這些基因可能在癌癥的發生過程中起著非常重要的作用。
基于本研究成果，研究人員對潛在的HBV整合規律及其致癌機制進行了推測。他們發現HBV整合所具有的某些特征有助于病毒控制被感染的宿主基因，如HBV整合位點的偏向性以及HBV整合位點拷貝數目變異（CNV）增加等，這些變化將會影響染色體的穩定性及引起基因表達的改變。此外，研究還發現HBV整合與患者的臨床表現密切相關。發生HBV整合的患者會更早地發展成為肝細胞癌而且治愈率更低。因此，通過對HBV整合的干預治療可能有助于防止癌癥的惡化，延長病人的生命。
【基因測序全面揭示乙肝病毒整合機制】華大基因該項目負責人鄭漢城表示：“這是首次從全基因組水平上探索肝癌患者中的HBV整合的分子機制。我們獲得的數據和研究結果將使科研人員更加深入地了解HBV的致癌原因。考慮到目前不太理想的臨床治療效果，我們認為應該充分重視高危人群的疫苗接種預防，并考慮從HBV整合干預治療的角度制定臨床治療策略，從而有效阻止病人癌癥的惡化延長病人的生命。”
該項目負責人、香港大學榮譽副教授、新加坡國立大學的Ken Sung博士說：“該研究成果將為進一步深入研究HBV整合在促進肝癌發展和影響臨床治療中的作用機制提供了新的思路，我希望我們的下一步研究工作能夠進一步有助于提高肝癌的診斷和預防。”
ACRG董事會董事、禮來公司腫瘤轉化科學高級總監Christoph Reinhard博士說：“我們在較大的癌癥患者群體中所發現的腫瘤分子特征，對開發更加具有針對性和有效的藥物具有十分重要的科研價值。ACRG的建立就是希望通過非競爭性合作，加快對亞洲最常見的癌癥的研究，本研究成果也證實了團結合作的重要性。”

EurekAlert!