從眾多基因組中挑出一種新的基因組 _海洋

【從眾多基因組中挑出一種新的基因組】

圖形視圖為海洋微生物群落中的組裝宏基因組DNA序列
單獨一滴海水中常常就會充斥著微觀生命。但是傳統上，要分離出某單一物種并給其整個的基因組測序一直是極端困難的。如今，研究人員說，他們研發出了一種從一個大型的、有著許多生物的宏基因組樣本中將某單一基因組解析出來的方法。
Vaughn Iverson及其同事從華盛頓州的普吉特灣中收集其中含有數百萬計的微生物的表層海水，并在他們的樣本中找出了一種特別的微生物——海洋II組廣古生菌。這一相當神秘的古細菌門以前從來沒有被培養過，而研究人員所收集的其基因組材料只代表了其整個宏基因組樣本的1.7% 。然而， Iverson及其同事仍然能夠從他們在普吉特灣海水中分離出的零零星星的片段中拼湊出一個幾近完整的廣古生菌的基因組。顯然，這些生物是能動的，并與細菌進行了廣泛的基因交換。
據研究人員披露，該新的基因組還提供人們有關變形菌視紫紅質——這是某些細菌用來從陽光中收獲能量的一種分子——起源的某些端倪。Iverson及其同事提示，他們的從宏基因組樣本中分離個別基因組的方法可能對發現還未培養的微生物在我們的環境中所扮演的不同作用有幫助。

EurekAlert!