科研干貨Pubmed檢索實(shí)用指南 pubmed高級(jí)檢索方法 _生活經(jīng)驗(yàn)

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作者：解螺旋.小米
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Pubmed是國(guó)際上公認(rèn)的最具權(quán)威的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)，檢索文獻(xiàn)用Pubmed，一般人都知道。不過(guò)解螺旋還是會(huì)經(jīng)常收到讀者關(guān)于Pubmed和文獻(xiàn)檢索各種各樣的問(wèn)題，今天咱們就一次性解決問(wèn)題，把Pubmed的基本、高級(jí)和精準(zhǔn)檢索功能做個(gè)梳理，大家各取所需吧。
基本檢索功能

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呦，還不一樣？對(duì)于輸入Pubmed的多詞詞組，它會(huì)查詢(xún)?cè)~組索引，如果查到相應(yīng)詞組會(huì)將其作為一個(gè)檢索詞來(lái)檢索，如果沒(méi)有查到相應(yīng)詞組，則將其拆分成單個(gè)詞分別檢索。所以liver cancer lncRNA就相當(dāng)于Liver AND cancer AND lncRNA，我不想把詞組分開(kāi)咋辦？可以通過(guò)以下方法：
加雙引號(hào)：“l(fā)iver cancer”“l(fā)ncRNA”
加標(biāo)段標(biāo)識(shí)[tw]：liver cancer[tw] lncRNA
加短橫線“-”：liver-cancer lncRNA
加截詞符“*”：liver cancer* lncRNA
如果檢索完畢你對(duì)這篇文章感興趣，則直接點(diǎn)擊進(jìn)入即可：

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左邊是文章摘要和作者信息等，右邊兩個(gè)紅框是全文鏈接：

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LinkOut-more resources這里也可以鏈接到數(shù)據(jù)庫(kù)哦：

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點(diǎn)擊任意一個(gè)進(jìn)入相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫(kù) ，會(huì)有pdf標(biāo)識(shí)的鏈接，然后就能下載啦!

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查詢(xún)的關(guān)鍵詞類(lèi)型大致可以分為：
詞語(yǔ)（主題）檢索：在檢索框中直接鍵入英文單詞或短語(yǔ)，大小寫(xiě)都可。
著者檢索：在檢索框中鍵入著者姓氏全稱(chēng)和名字的首字母縮寫(xiě)，注意格式為：著者姓空格名字首字母縮寫(xiě)"，如施一公，shi yg.
刊名檢索：在檢索框中鍵入刊名全稱(chēng)或medline形式的簡(jiǎn)稱(chēng)、ISSN號(hào)，例如：molecularbiology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524，然后回車(chē)或點(diǎn)擊Go,系統(tǒng)將在刊名字段檢索，并顯示檢索結(jié)果。
日期檢索：在檢索框中鍵入日期或日期范圍，日期的錄入格式為YYYY/MM/DD；如：1999/09/08；只用年份或年月，如：2000或1999/12 。
期刊子集（輯）檢索：檢索詞ANDjsubseta,如：neoplasm AND jsubseta 。可供檢索的期刊子庫(kù)有3種：Abridged Index Medicus（有120種重要核心期刊）、Dental和Nursing 。分別使用jsubseta,jsubsetd, jsubsetn進(jìn)行限定。
【科研干貨Pubmed檢索實(shí)用指南 pubmed高級(jí)檢索方法】檢索帶文摘的記錄：檢索的格式為：檢索詞AND has abstract, 如：liver cancer ANDhas abstract 。要注意的是在1975年前出版的文章，其MEDLINE記錄中沒(méi)有文摘。
布爾邏輯檢索：PubMed系統(tǒng)允許使用布爾邏輯檢索，只要在檢索框中鍵入布爾邏輯運(yùn)算符（AND，OR或NOT）。具體使用時(shí)要注意的問(wèn)題，詳見(jiàn)上第2點(diǎn)所述。
高級(jí)檢索功能
如果你要是有所針對(duì)，特異性的搜索具體作者、雜志或者其他信息等，還可以進(jìn)行更加高級(jí)的檢索，高級(jí)檢索技巧有兩個(gè)入口：一個(gè)入口是通過(guò)搜索前的advanced進(jìn)入，就在pubmed首頁(yè)搜索框的下面。

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這里有三個(gè)高級(jí)搜索選型：
1.是左側(cè)的and or not選項(xiàng)，很好理解。
2.是搜索框選型，fieids，選擇你需要選擇的搜索范圍。
3.是index索引，以cancer為例，點(diǎn)擊list，出現(xiàn)下圖內(nèi)容，可以很方便的選擇子方向，這個(gè)選項(xiàng)可以大大的提高我們的檢索效率，縮小工作范圍。
第二個(gè)功能入口：是我們搜索之后的界面，在左側(cè)的選項(xiàng) 。

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還是以cancer為例，左側(cè)出現(xiàn)了additional filter，這里我們可以把我們需要的內(nèi)容進(jìn)行篩選，比如我需要找到臨床試驗(yàn)類(lèi)型的文章，就在article types 中點(diǎn)擊clinical trial，需要查看最近5年的文章，就選擇publication data 5 years ，等等。這個(gè)功能能夠幫助我們快速的篩選出我們需要的文章類(lèi)型，很好用。
想要查看pubmed的檢索的詳細(xì)內(nèi)容，可以點(diǎn)擊右下側(cè)的search details ，點(diǎn)擊see more，你將會(huì)看到pubmed的全部搜索信息，同時(shí)提供修改。
精準(zhǔn)檢索功能
PubMed上找論文時(shí)，如果關(guān)鍵詞好幾個(gè)，由于單詞間的空格鍵存在AND命令，導(dǎo)致明明要搜的是詞組，搜索不是被放大就是縮小，很難檢索到合適且關(guān)聯(lián)度高的文。例如，你想找和腸炎與腫瘤壞死因子相關(guān)論文，搜索關(guān)鍵詞：Inflammatory bowel disease TNF 。結(jié)果如下：

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試試搜索關(guān)鍵詞：IBD TNF

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如果還想要基因檢測(cè)方向的呢？搜關(guān)鍵詞：genetic test IBD TNF

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用簡(jiǎn)稱(chēng)縮寫(xiě)確實(shí)一下子就將目標(biāo)范圍縮小了好幾倍，然而很多詞匯并沒(méi)有簡(jiǎn)稱(chēng)，而且由于單詞間的空格存在AND命令，將多個(gè)關(guān)鍵詞一起輸入時(shí)很容易導(dǎo)致找不到，需要交集計(jì)算的太多啦！找個(gè)文獻(xiàn)難不成還要先熟練一下搜索命令又是引號(hào)又是括號(hào)嗎？當(dāng)然不用啦，又不是程序員！
怎么才能快速搜到我想要的論文呢？別急，看看下面在基因檢測(cè)方向怎樣快速靶向定位的例子，你就一切都了然了。
1、首先選擇PudMed的使用工具下的臨床資料（Clinical Queries）

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2、輸入一級(jí)關(guān)鍵詞”IBD”

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3、在左右兩邊的臨床研究目錄以及臨床遺傳學(xué)下選擇范圍，如病因、診斷、治療、預(yù)后和臨床預(yù)測(cè)指南等。

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選擇右下的see all，回到PubMed主頁(yè) 。
4、輸入你的二級(jí)關(guān)鍵詞：TNF，根據(jù)你的需要選擇排序方式。例如，出版時(shí)間、關(guān)聯(lián)度、雜志等。選擇很多年前的文章作為參考文獻(xiàn)，數(shù)量就不能多！如果五年十年前的參考文獻(xiàn)超過(guò)70%，這是打算寫(xiě)給誰(shuí)看呢？

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OK啦，你的目的達(dá)到了。
除此之外，你也可以通過(guò)布爾（BOOLEAN）運(yùn)算來(lái)提高你的效率，最常用的三種布爾運(yùn)算即是AND,OR和NOT 。
AND提供的運(yùn)算方式即不管所輸入的兩個(gè)關(guān)鍵詞語(yǔ)并列列出， OR則是將出現(xiàn)至少一個(gè)關(guān)鍵詞的文章列出，這種運(yùn)算在想將相似主題的文章羅列在一起時(shí)，十分有效。NOT運(yùn)算可以在你的檢索范圍內(nèi)將某些不需要的部分除去。
但是在使用的時(shí)候要特別注意，會(huì)有可能將一些你所需要的文章漏掉。比如當(dāng)你的檢索詞為L(zhǎng)EAD POISONING NOT CHILDREN時(shí) ，除了會(huì)刪除掉那些僅討論兒童的文章，同時(shí)也會(huì)刪去那些同時(shí)討論兒童及其他年齡組的文章。
收尾：批量保存和打印文獻(xiàn)
Pubmed建立的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)，免費(fèi)文獻(xiàn)比例有限，不過(guò)一般高校都會(huì)買(mǎi)數(shù)據(jù)庫(kù)權(quán)限，大家在校園局域網(wǎng)內(nèi)可以任性下載文獻(xiàn)、了解領(lǐng)域內(nèi)科研前沿。檢索好自己想要的文獻(xiàn) ，免不了要收藏保存。打開(kāi)Summary下拉菜單選擇其中一種格式，然后點(diǎn)擊Save鍵；要保存特定記錄時(shí)，點(diǎn)擊記錄左邊的選擇框予以標(biāo)記后，再點(diǎn)擊Save鍵。
使用瀏覽器的打印功能，即可把感興趣的內(nèi)容打印出來(lái) 。系統(tǒng)允許每頁(yè)最多顯示500條記錄。如果想打印成文本格式，請(qǐng)先點(diǎn)擊Text鍵，然后再打印。到這 pubmed檢索的一些基本功能，了解更深入的功能請(qǐng)繼續(xù)關(guān)注解螺旋。
編后語(yǔ)：
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解旋螺——取解構(gòu)基礎(chǔ)與臨床雙螺旋人生之意。我們旨在傳播臨床基礎(chǔ)科研中有益的方法論，通過(guò)經(jīng)驗(yàn)和信息的分享積累學(xué)術(shù)能力。從零基礎(chǔ)到初窺門(mén)徑，從初窺門(mén)徑到游刃有余，一路相伴。做或不做科研，從醫(yī)之路大不同；關(guān)注或不關(guān)注解螺旋，科研之路大不同。
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